2015-йилда Испаниянинг “Виллареал” клубига қўшилишидан олдин, у билан 2019-йилда нафақага чиққан, у аввал Италиянинг “Брешия”, “Парма” ва хусусан, “Милан” клубларида ўйнаган ва у ерда 2010–11-йилги А Серия ва 2006–07-йилги УЭФА чемпионлигини қўлга киритган.
Халқаро миқёсда у Италия терма жамоасини 16 марта ҳимоя қилган; У шунингдек, 21 ёшгача бўлган Италия терма жамоаси билан 2004-йилги УЭФА У-21 Европа чемпионатида ғолиб чиқди, шунингдек, 2004-йилги Ёзги Олимпия ўйинларида бронза медалини қўлга киритди.
Бонера 1995-йилда "Бресcиа" билан шартнома имзолади ва 1998-99-йилги мавсум охиригача "Бресcиа" ёшлар жамоаларида ўйнади ва у ерда 1999-2000-йилларда "Бресcиа" сафида илк дебютини ўтказди. У "Бресcиа" билан уч мавсумда жами 72 ўйин ўтказди[2].
Парма
Бонера 2002-йил июл ойида "Парма" билан шартнома имзолаган. У 2002-03-йилларда Пармадаги биринчи мавсумида А Серияда 32 та ўйин ўтказди ва гол урди. "Парма" билан кейинги уч мавсумда у 98 та ўйин ўтказди, шулардан 82 таси А серияда. 2006-йил 28-июлда Бонера 3,3 миллион евро эвазига "Милан"га кўчиб ўтди[3].
Милан
Бонера "Милан" сафида ва "Торино" ҳужумчиси Роберто Муззини қувиб ўтмоқда
Бонера УЭФА Чемпионлар Лигаси 2006-йил 17-октябрда Белгиянинг "Андерлехт" жамоасига қарши ўйинда, 47-дақиқада у иккинчи сариқ карточка олиб, қизил карточка олди.
Ўн ойлик жароҳатдан сўнг, Бонера 2010-йил 13-январда Италия кубоги доирасида "Новара"га қарши оýинга тушди. Бонера Миланнинг тўғридан-тўғри ҳимоячисига айланди, аммо Жанлука Замбротта, Лука Антонини ва Массимо Оддо жароҳатдан қайтгач, у позициядаги бошланғич ўрнини йўқотди.
2013-йилнинг 23-майида, «Ювентус»га ўтиши ҳақидаги тахминлар фонида Бонера «Милан» билан 2015-йилнинг 30-июнига қадар янги шартнома имзолади. Бу икки йил давомида у асосан марказий ҳимоячилар Филипп Мексес ва Алекснинг захира ўйинчиси сифатида ўйнади.
Мураббийлик карераси
2019-йилнинг 9-июлида Бонера Марко Гиампаолонинг “Милан”даги янги мураббийлар штабининг бир қисми сифатида эълон қилинди ва яна клубга ёрдамчи мураббий сифатида қўшилди[4].
2020-йил ноябр ойида Пиоли ва ёрдамчиси Гиаcомо Муреллига CОВИД-19 ташхиси қўйилганидан сўнг, Бонера клубда вақтинчалик бош мураббий вазифасини бажарди[5].
Халқаро мартаба
Ёшлар даражасида Бонера 2002 ва 2004-йилларда 21 ёшгача бўлган ёшлар ўртасидаги Европа чемпионатларида қатнашган. У 2000-йилги Тулон турнирида ҳам ўйнаган. У 21 ёшгача бўлган халқаро мусобақаларда 34 марта ўйнаган.
Бонера 2001-йилдан 2008-йилгача Италия терма жамоаси сафида 16 марта майдонга тушган. 2001-йил 5-сентябрда "Гиованни Трапаттони" қўл остида Марокашга қарши ўйинда (1:0) ғалаба қозонганидан сўнг[6] 2006-йил ФИФА Жаҳон чемпионати саралашида Марcелло Липпи қўл остида ўртоқликдан ташқари дебют қилди[7]
У 2006-йилги ФИФА Жаҳон чемпионатига тўртта фавқулодда захира ўйинчиларидан бири сифатида чақирилган эди,[8]. аммо Гианлуcа Замбротта соғлом эканлиги тасдиқлангач, Бонера 23 кишилик якуний таркибдан четлаштирилди ва уйига жўнатилади[9].
2006-йилги Жаҳон чемпионатидан сўнг у биринчи марта янги бош мураббий Роберто Донадони қўл остида, 2007-йилнинг 28-мартига белгиланган Шотландияга қарши Евро-2008 саралаш ўйини олдидан қайта чақирилди[10]. Бироқ жароҳати туфайли у ўйинни тарк этишга мажбур бўлди[11]. 2007-йилнинг октябр ва ноябр ойларида у яна чақирув олди[12][13]. У 2010-йилги Жаҳон чемпионати мезбони Жанубий Африкага қарши ўртоқлик ўйинида Италия терма жамоаси билан[14] ҳамда Евро-2008 саралашида Фабио Каннаваро ўрнига 3:1 ҳисобида майдонга тушди.
Марcелло Липпи иккинчи марта Италия терма жамоаси бош мураббийи бўлганидан сўнг, Бонера Липпининг дастлабки бир неча ўйинларида қайта чақирилди[15][16], аммо кейинчалик жароҳати туфайли жамоасига киритилмади[17]. Жароҳатдан сўнг Бонера Италия терма жамоасининг Камерунга қарши ЖЧ-2010 таркиби расман эълон қилинишидан олдин охирги ўртоқлик учрашувига чақирилди[18][19]. Бироқ у 11-май кунлари бўлиб ўтган жаҳон чемпионатининг дастлабки таркибига ҳам, 4–5-май кунлари бўлиб ўтган йиғинга ҳам кира олмади[20].
Шахсий ҳаёт
Даниэле Бонера Паола Бонера билан турмуш қурган[21]. Бонеранинг рафиқаси Талита Бонера исмли қизи билан битта фарзанди бор[22].
2020-йил 13-октябрда у CОВИД-19 учун ижобий натижа берди[23].